男性的阴茎短小主要与下列因素有关，主要有七大因素：：

　　一、遗传基因：较为根本因素是遗传基因的影响。

　　二、包皮过长，缺乏生长的必要空间，阻碍阴茎的发育生长。

　　三、曾患有睾丸炎、隐睾症、睾丸发育不全等症及内分泌不平衡，雄性激素不足。

　　四、后天性的阴茎短小，主要是因睾丸萎缩引起，例如：长其从事微波、超声、高温等作业的男性，青春期前腮脉炎合并睾丸寒及长期食用粗制棉籽油等，均可以引起睾丸萎缩。

　　五、青少年发育期间摄入的锌原素、雄性激素、维生素E和相关蛋白营养不足，缺乏后天能量补充，起不到壮大性器官的作用。

　　六、在母体怀孕期间因用药不当影响到雄性激素的分泌，产生先天不足，缺乏健壮性机能的营养和原素，形成先天发育不良。

　　七、性生活过度、身体虚弱或在青少年刚发育期间手淫过频，使肾脏在发育时无能量去壮大发育性器官，形成阴茎短小。